Daniel Heller schloss seine Studien in Geschichte, Wirtschaftsgeschichte und Politikwissenschaften an der Universität Zürich 1988 mit dem Doktortitel (Dr. Phil. I) ab. Heute ist er Partner bei Farner Consulting AG (Zürich, Bern, Basel und Lausanne), der führenden Schweizer Kommunikationsberatungsfirma. Bei Farner leitet er den Marktbereich Public Affairs. Seine Spezialitäten sind Beratungen und Umsetzungen in den Bereichen Politik, Strategie und Krisenkommunikation.
Für die FDP sitzt er im aargauischen Kantonsparlament, wo er seit 2004 die Freisinnige Fraktion präsidiert. Er war aktiv in der Bildungspolitik (Präsidium Kommission Erziehung, Bildung und Kultur, Vizepräsidium Fachhochschulkommission).
Daneben präsidiert er den Verwaltungsrat der Clientis Bank Küttigen Erlinsbach AG und sitzt im Verwaltungsrat der Clientis AG (Schweizer Regionalbanken, Bern). Weitere Verwaltungsratsmandate hält er in Industrie (Vizepräsident Franke Management AG, Aarburg) und Gesundheitswesen (u.a. Präsident Klinik Barmelweid AG).
Daniel Heller wohnt mit seiner Frau Véronique in Erlinsbach und hat drei Kinder.